De reptielen en amfibieën collectie omvat zo’n 100.000 tot 150.000 krokodillen, schildpadden, slangen, hagedissen, kikkers en salamanders. Een van de topstukken is de Japanse reuzensalamander die door Von Siebold in Japan is verzameld. De collectie groeit nauwelijks omdat veel amfibieën en reptielen tegenwoordig beschermde dieren zijn die zonder vergunning niet verzameld mogen worden. De collectie dient dus vooral als historisch en taxonomisch archief voor onderzoek naar soorten die leven of leefden in bijvoorbeeld Indonesië of het Amazonegebied. Het overgrote deel van de collectie wordt in potten met alcohol bewaard. De uiterlijke kenmerken zoals huid en schubben blijven dan goed intact en dit zijn de kenmerken waar wetenschappers voornamelijk naar kijken om soorten te onderscheiden.

Alternative form voor Collectie reptielen en amfibieën : subcollection|amphibia_and_reptilia.