Ruim 150.000 haaien, roggen en beenvissen vormen samen de vissencollectie. Vrijwel alle exemplaren worden op alcohol bewaard. Op deze manier blijft de vorm van het dier en al zijn onderdelen zoals huid, schubben, ogen en kieuwen intact en zijn ze makkelijk door wetenschappers te bestuderen. Een nadeel van deze bewaarmethode is dat de dieren hun kleuren grotendeels verliezen. De objecten zijn voornamelijk verzameld in Europa, Zuidoost-Aziƫ, Afrika en Suriname. Bijzondere objecten in deze collectie zijn onder andere de 20.000 cichliden uit het Victoriameer en de ruim 800 barbelen uit het Tanameer. Deze zijn interessant voor biologen die onderzoek doen naar evolutie en het ontstaan van nieuwe soorten. Ook bevat de collectie vissen historische verzamelingen uit de 19e eeuw, onder andere die van Pieter Bleeker en Von Siebold.
Alternative form voor Collectie vissen : subcollection|pisces.