De vogelcollectie omvat ongeveer 400.000 exemplaren en bestaat voornamelijk uit opgezette en gebalgde vogelhuiden, skeletten, eieren en nesten. Ze zijn bijeengebracht door verschillende (Nederlandse) verzamelaars. Ook zijn er vogels uit dierentuinen en gewone tuinen, waaronder raamslachtoffers. Bijzondere objecten in de collectie zijn bijvoorbeeld de darwinvinken die door Darwin zelf zijn verzameld, en een aantal uitgestorven vogels, waaronder het samengestelde skelet van een dodo. De collectie bevat naast veel Nederlandse soorten ook soorten uit Japan, Indonesië, Suriname en de Nederlandse Antillen die verzameld zijn in de koloniale tijd. Onderzoek aan de collectie draagt bij aan bijvoorbeeld het beschermen van soorten in die gebieden.

Alternative form voor Collectie vogels : subcollection|aves.